SVMCrossVal.git

private/main.m  1) function main(model,task)
private/main.m  2) 
private/main.m  3) % parse the GUI and pass parameters as structure
private/main.m  4) disp('RUN');

private/main.m  5) % disp('all warnings OFF')
private/main.m  6) % warn = warning('off','all');
private/main.m  7) 

private/main.m  8) timeLine = getTimeLineParams(model);
private/main.m  9) subjects = getSubjectCellList(model);
private/main.m 10) classDef = parseClassDef(model);

private/main.m 11) 
private/main.m 12) mask     = ['^' cell2mat(getImageFileMask(model)) '.*\.img$'];

private/main.m 13) % images
private/main.m 14) % normalization
private/main.m 15) 
private/main.m 16) switch task
private/main.m 17)     case 'COORD'
private/main.m 18)         disp('COORD');

private/main.m 19)         coordargs = struct;
private/main.m 20)         coordargs.subjects = subjects;
private/main.m 21)         coordargs.timeline = timeLine;
private/main.m 22)         coordargs.basedir = model.baseDir;
private/main.m 23)         coordargs.sessionList = 1:3;
private/main.m 24)         coordargs.eventList = classDef.eventMatrix;
private/main.m 25)         coordargs.coords = parseCoordinateTextField(model);
private/main.m 26)         coordargs.mask   = mask;
private/main.m 27)         
private/main.m 28)         runCoordTable(coordargs)

private/main.m 29)         

private/main.m 30)     case 'ROI'
private/main.m 31)         disp('ROI');

private/main.m 32)         roiargs = struct;

private/main.m 33)         roiargs.subjects    = subjects;
private/main.m 34)         roiargs.timeline    = timeLine;
private/main.m 35)         roiargs.classes     = classDef;
private/main.m 36)         roiargs.mask        = mask;
private/main.m 37)         roiargs.basedir     = model.baseDir;
private/main.m 38)         roiargs.sessionList = 1:3;
private/main.m 39)         roiargs.eventList   = classDef.eventMatrix;

private/main.m 40)         
private/main.m 41)         runROIImageMaskMode(roiargs);
private/main.m 42)         

private/main.m 43)     case 'FBS'
private/main.m 44)         disp('FBS')

private/main.m 45)         
private/main.m 46)     case 'SVM'
private/main.m 47)         disp('classify with svm');
private/main.m 48)         
private/main.m 49)     case 'X-SVM'
private/main.m 50)         
private/main.m 51)     case 'SOM'
private/main.m 52) 
private/main.m 53)     case 'X-SOM'
private/main.m 54)         

private/main.m 55) end
private/main.m 56) 

private/main.m 57) % disp('warings restored');
private/main.m 58) % warning('on',warn);

main.m         59) end

main.m         60) 
main.m         61) 
main.m         62)