SVMCrossVal.git

1) function ui_main(varargin)
2) 

3) DEFAULT.selectedSubject = [2];

4) 

5) DEFAULT.pststart        = -5;
6) DEFAULT.pstend          = 15;
7) DEFAULT.baselinestart   = 0;
8) DEFAULT.baselineend     = 0;

9) DEFAULT.trfactor        = 0.5;

10) DEFAULT.frameshiftstart = -5;

11) DEFAULT.frameshiftend   = 15;

12) DEFAULT.frameshiftdur   = 0;
13) DEFAULT.classdefstring  = 'left,\t[9,11,13]\nright,\t[10,12,14]';

14) DEFAULT.voxelstring     = 'M1 l + 3 \nM1 r + 3\n';

15) DEFAULT.svmoptstring    = '-s 0 -t 0 -c 1';
16) DEFAULT.svmnfold        = '6';

17) DEFAULT.svmrnd          = 1;

18) DEFAULT.searchlightradius = 3;

19) DEFAULT.searchlightTimeline = '';

20) DEFAULT.somM = 3;
21) DEFAULT.somN = 3;
22) DEFAULT.somLattice = 1;

23) 

24) 

25) DEFAULT.wd  = fullfile('d:','Analyze','Choice','24pilot');
26) % DEFAULT.wd  = fullfile('/','media','fMRI');

27) 

28) %  Initialize and hide the GUI as it is being constructed.
29)     frameWidth=450;

30)     frameHeight=450;

31)     
32)     frame = figure('Visible','off','Position',[0,0,frameWidth,frameHeight]);
33)     movegui(frame,'west'); % get this thing visible on smaller displays.
34)     set(frame,'Name','SVMCrossVal Decode Performance 4 SPM');
35)     set(frame,'NumberTitle','off');
36)     set(frame,'MenuBar','none');

37) %     set(frame,'Color',get(0,'defaultUicontrolBackgroundColor'));

38)     set(frame,'Resize','on');

39)     set(frame,'Units','normalized');

40)     set(frame,'Color','y');

41) 

42)     task = struct;
43)     

44)     model1 = struct;
45)     model1.baseDir = DEFAULT.wd;

46) 

47)     model1.txtBaseDir = createLabel(frame,[0 0.97 1 0.03],model1.baseDir);
48)     set(model1.txtBaseDir,'BackgroundColor','w');
49)     set(model1.txtBaseDir,'ForegroundColor','b');

50)     

51)     TASK_HEIGHT = 1-0.13;
52)     
53)     % PREPROCESSING
54)     task.preprocessing   = uipanel(frame,'Title','Preprocessing','Position',[0 0.0 1 TASK_HEIGHT]);
55)     set(task.preprocessing,'BackgroundColor','w');
56)     set(task.preprocessing,'Units','normalized');

57)     

58)     model1.selectedSubject = DEFAULT.selectedSubject;
59)     model1 = createFirstStepPanel(model1,task.preprocessing,DEFAULT);

60)     

61)     % fill with data
62)     model1 = scanDirs(model1);

63)     

64)     % CLASSIFICATION

65)     model2 = struct;
66)     

67)     task.classification = uipanel(frame,'Title','Classification','Position',[0 0.0 1 TASK_HEIGHT]);
68)     set(task.classification,'BackgroundColor','w');

69)     model2 = createSecondStepPanel(model2,task.classification,DEFAULT);

70)     

71)     % PLOT

72)     model3 = struct;

73)     task.plot = uipanel(frame,'Title','Plot','Position',[0 0.0 1 TASK_HEIGHT]);
74)     set(task.plot,'BackgroundColor','w');

75)     model3 = createVisualStepPanel(model3,task.plot,DEFAULT);

76)     

77)     % TASK

78)     task.taskSwitch = uibuttongroup(frame,'Position',[0 1-0.13 1 0.10]);
79)     % controlls togglebuttons

80) %         set(task.taskSwitch,'Title','TASK');
81)         set(task.taskSwitch,'BackgroundColor','w');
82)         set(task.taskSwitch,'Units','normalized');
83)     

84)         btnSwitchPreprocessing = uicontrol(task.taskSwitch,'Style','pushbutton',...
85)             'String','ImageProcessing',...

86)             'Units','normalized','Position',[0.0 0.0 0.33 1]);

87)         set(btnSwitchPreprocessing,'Callback',{@cbSwitchTask,'PRE',task,model1}); 

88)         set(btnSwitchPreprocessing,'Enable','on');
89) 

90)         btnSwitchClassify = uicontrol(task.taskSwitch,'Style','pushbutton',...
91)             'String','Decode',...

92)             'Units','normalized','Position',[0.33 0.0 0.33 1]);

93)         set(btnSwitchClassify,'Callback',{@cbSwitchTask,'CLASSIFY',task,model2}); 

94)         set(btnSwitchClassify,'Enable','on');
95) 

96)         btnSwitchPlot = uicontrol(task.taskSwitch,'Style','pushbutton',...
97)             'String','Plot',...

98)             'Units','normalized','Position',[0.66 0.0 0.33 1]);

99)         set(btnSwitchPlot,'Callback',{@cbSwitchTask,'PLOT',task,model3}); 

100)         set(btnSwitchPlot,'Enable','on');
101) 
102)     % menu
103)     

104)     savemenu = uimenu(frame,'Label','Save/Load','Enable','off');

105)         uimenu(savemenu,'Label','Save Preprocessing Parameter','Callback',{@mcb_save,model1},'Enable','off');
106)         uimenu(savemenu,'Label','Load Preprocessing Parameter','Callback',{@mcb_load,model1},'Enable','off');

107)         uimenu(savemenu,'Label','Save Decode Parameter','Callback',{@mcb_save,model2},'Enable','off');
108)         uimenu(savemenu,'Label','Load Decode Parameter','Callback',{@mcb_load,model2},'Enable','off');
109)         uimenu(savemenu,'Label','Save All','Callback',{@mcb_save,model1},'Enable','off');
110)         uimenu(savemenu,'Label','Load All','Callback',{@mcb_load,model1},'Enable','off');
111)         
112)     uimenu(frame,'Label','change Study','Callback',{@mcb_cd,model1},'Enable','off');

113)     

114)     cbSwitchTask(0,0,'PRE',task,model1);

115) 

116) 

117)     set(frame,'Visible','on');
118) 

119) end

120) 
121) function model = createFirstStepPanel(model,parent,DEFAULT)

122) 

123)     main_grid = cell(2,4);
124)     main_grid{1,1} = [0 0.7 0.4 0.3];
125)     main_grid{1,2} = [0 0.5 0.5 0.2];
126)     main_grid{1,3} = [0 0.1 0.5 0.4];
127)     main_grid{1,4} = [0 0.0 1.0 0.1];

128)     

129)     main_grid{2,1} = [0.4 0.7 0.6 0.3];
130)     main_grid{2,2} = [0.5 0.5 0.5 0.2];
131)     main_grid{2,3} = [0.5 0.1 0.5 0.4];

132)     
133)     %Subjects

134)     pSubject = uipanel(parent,'Units','normalized','Position',cell2mat(main_grid(1,1)));
135)     set(pSubject,'Title','Subjects');
136)     set(pSubject,'BackgroundColor','w');
137)     
138)     subjectList = {'DUMMY Subj1','DUMMY Subj2','DUMMY Subj3','DUMMY Subj4'};
139)     model.subjectSelector = uicontrol(pSubject,'Style','listbox',...

140)                     'Min',1, 'Max',3,...
141)                     'String',subjectList,...
142)                     'UserData',subjectList,...
143)                     'Units','normalized',...

144)                     'Position',[0 0 1 1]);

145)     set(model.subjectSelector, 'FontName', 'FixedWidth');

146)     set(model.subjectSelector,'BackgroundColor','w');

147)     
148)     %Classes

149)     pClasses = uipanel(parent,'Units','normalized','Position',cell2mat(main_grid(1,2)));

150)     set(pClasses,'Title','Class Definitions');
151)     set(pClasses,'BackgroundColor','w');
152)         lClassDef = uicontrol(pClasses,...
153)             'Style','text',...
154)             'String',sprintf('<Label>,\t <[Event, Event, ..]>;'),...
155)             'Units','normalized',...
156)             'Position',[0 0.8 1 0.2]);
157)         set(lClassDef,'BackgroundColor','w');
158)         set(lClassDef,'HorizontalAlignment','left');
159)         
160)         model.txtClassDef = uicontrol(pClasses,'Style','edit',...
161)             'String',sprintf(DEFAULT.classdefstring),...
162)             'Units','normalized',...
163)             'Position',[0 0 1 0.8]);
164)         set(model.txtClassDef,'HorizontalAlignment','left');
165)         set(model.txtClassDef,'Max',20);
166)         set(model.txtClassDef,'Min',0);
167)         set(model.txtClassDef, 'FontName', 'FixedWidth');

168)         set(model.txtClassDef, 'BackgroundColor', 'w');

169) 
170) 
171)     %Timeline

172)     pPSTH        = uipanel(parent,'Title','PSTH Options','Position',cell2mat(main_grid(2,1)));

173)     set(pPSTH,'BackgroundColor','w');
174)         
175)         grid_h = 0.16;
176)         grid_w = 0.3;
177)         

178)         tl_grid = cell([3 6]);
179)         tl_grid{2,1} = [0.0 0.83 grid_w grid_h];
180)         tl_grid{2,1} = [0.4 0.83 grid_w grid_h];
181)         tl_grid{3,1} = [0.7 0.83 grid_w grid_h];

182)         

183)         tl_grid{1,2} = [0.0 0.66 grid_w grid_h];
184)         tl_grid{2,2} = [0.4 0.66 grid_w grid_h];
185)         tl_grid{3,2} = [0.7 0.66 grid_w grid_h];

186) 

187)         tl_grid{1,3} = [0.0 0.5 grid_w grid_h];
188)         tl_grid{2,3} = [0.4 0.5 grid_w grid_h];
189)         tl_grid{3,3} = [0.7 0.5 grid_w grid_h];

190)         

191)         tl_grid{1,4} = [0.0 0.33 grid_w grid_h];
192)         tl_grid{2,4} = [0.4 0.33 grid_w grid_h];
193)         tl_grid{3,4} = [0.7 0.33 grid_w grid_h];

194) 

195)         tl_grid{1,5} = [0.0 0.16 grid_w grid_h];
196)         tl_grid{2,5} = [0.4 0.16 grid_w grid_h];
197)         tl_grid{3,5} = [0.7 0.16 grid_w grid_h];

198)         

199)         tl_grid{1,6} = [0.0 0.0 0.5 grid_h];
200)         tl_grid{2,6} = [0.5 0.0 grid_w grid_h];
201)         tl_grid{3,6} = [0.75 0.0 grid_w grid_h];
202) 
203)         lStart      = createLabel(pPSTH, cell2mat(tl_grid(2,1)) ,'Start [sec]');
204)         lEnd        = createLabel(pPSTH, cell2mat(tl_grid(3,1)) ,'End [sec]');
205)         lPSTH       = createLabel(pPSTH, cell2mat(tl_grid(1,2)),'PSTH Range');
206)         lBaseline   = createLabel(pPSTH, cell2mat(tl_grid(1,3)),'Baseline');

207)         lTRF        = createLabel(pPSTH, cell2mat(tl_grid(1,5)),'TR Factor');

208) 

209)         model.txtPSTHStart         = createTextField(pPSTH,cell2mat(tl_grid(2,2)),DEFAULT.pststart);
210)         model.txtPSTHEnd           = createTextField(pPSTH,cell2mat(tl_grid(3,2)),DEFAULT.pstend);
211)         model.txtBaselineStart     = createTextField(pPSTH,cell2mat(tl_grid(2,3)),DEFAULT.baselinestart);
212)         model.txtBaselineEnd       = createTextField(pPSTH,cell2mat(tl_grid(3,3)),DEFAULT.baselineend);

213)         model.txtTrFactor          = createTextField(pPSTH,cell2mat(tl_grid(2,5)),DEFAULT.trfactor);
214)         model.labelTR              = createTextField(pPSTH, cell2mat(tl_grid(3,5)),'');

215)         
216)         % images

217)         pImage = uipanel(parent,'Title','Image Options','Position',cell2mat(main_grid(2,2)));

218)         set(pImage,'BackgroundColor','w');
219) 
220)         createLabel(pImage,[0.0 0.5 1 0.5],'Select Image Base');
221)         

222)         imageRegExList = {'DUMMY f*.IMG','DUMMY swrf*.IMG','DUMMY wrf*.IMG'};

223)         model.imageTypeSelection = uicontrol(pImage,'Style','popupmenu',...
224)         'Units','normalized',...
225)         'Position',[0.0 0.0 1 0.5],...
226)         'String',imageRegExList,...
227)         'UserData',imageRegExList,...

228)         'Value',3);

229)         set(model.imageTypeSelection,'BackgroundColor','w');
230)         
231)         
232)         % coordinate Table

233)         pVoxel = uipanel(parent,'Title','ROI','Position',cell2mat(main_grid(1,3)));

234)         set(pVoxel,'BackgroundColor','w');

235)         lVoxelDef = createLabel(pVoxel, [0 0.9 1 0.1],'<ROI Name> [+ radius (mm)];');

236)         model.txtVoxelDef = createTextField(pVoxel,[0 0 1 0.9],...
237)             sprintf(DEFAULT.voxelstring));
238)         set(model.txtVoxelDef,'HorizontalAlignment','left');
239)         set(model.txtVoxelDef,'Max',20);
240)         set(model.txtVoxelDef,'Min',0);
241)         set(model.txtVoxelDef, 'FontName', 'FixedWidth');
242)         

243)         %normalizations
244)         pNorm = uipanel(parent,'Title','Normalization','Position',cell2mat(main_grid(2,3)));
245)         set(pNorm,'BackgroundColor','w');
246)         

247)         createLabel(pNorm,[0 0.75 1 0.25],'psth norm4SVM');
248)         norm1Model = {'none','mean','minmax'};

249)         model.selNormPST = uicontrol(pNorm,'Style','popupmenu',...
250)             'Units','normalized',...
251)             'Position',[0.0 0.5 1 0.25],...
252)             'String',norm1Model,...
253)             'UserData',norm1Model,...

254)             'Value',2);

255)          set(model.selNormPST,'BackgroundColor','w');   
256)         

257) %         createLabel(pNorm,[0 0.25 1 0.25],'Col Bias removal');
258) %         norm2Model = {'on','off'};
259)         model.chkColBias = uicontrol(pNorm,'Style','checkbox',...

260)             'Units','normalized',...

261)             'Position',[0.0 0.1 1 0.25],...
262)             'String','column Bias removal',...
263)             'Enable','on',...

264)             'Value',1);

265)          set(model.chkColBias,'BackgroundColor','w');   

266)         
267)         %buttons
268)         pButtons = uipanel(parent,'Position',cell2mat(main_grid(1,4)));
269)         set(pButtons,'BackgroundColor','w');

270)         

271)         btnRunButton1 = uicontrol(pButtons,'String','run coord-Table',...
272)             'Units','normalized','Position',[0 0 0.33 1]);

273)         set(btnRunButton1,'Callback',{@cbRunPreprocessing,model,'COORD'}); % set here, because of model.    
274)         set(btnRunButton1,'Enable','on');

275)         

276)         btnRunButton2 = uicontrol(pButtons,'String',sprintf('load ROI for FBS'),...

277)             'Units','normalized','Position',[0.33 0 0.33 1]);

278)         set(btnRunButton2,'Callback',{@cbRunPreprocessing,model,'FBS'}); % set here, because of model.  

279)         set(btnRunButton2,'Enable','on');

280)         

281)         btnRunButton3 = uicontrol(pButtons,'String','run ROI-Image processing',...
282)             'Units','normalized','Position',[0.66 0 0.33 1]);

283)         set(btnRunButton3,'Callback',{@cbRunPreprocessing,model,'ROI'}); % set here, because of model.    
284)         set(btnRunButton3,'Enable','on');
285) end
286) 

287) function model = createSecondStepPanel(model,parent,DEFAULT)
288) basecolor = 'w';
289) 

290) pTime = uipanel(parent,'Units','normalized','Position',[0.0 0.8 1 0.2]);
291)     set(pTime,'Title','Decode Timeframe Options');

292)     set(pTime,'BackgroundColor',basecolor);

293)     grid_h = 0.3;
294)     grid_w = 0.3;
295)     time_grid = cell([3 3]);
296)     time_grid{1,1} = [0.0 0.63 grid_w grid_h];
297)     time_grid{2,1} = [0.4 0.63 grid_w grid_h];
298)     time_grid{3,1} = [0.7 0.63 grid_w grid_h];
299)     time_grid{1,2} = [0.0 0.33 grid_w grid_h];
300)     time_grid{2,2} = [0.4 0.33 grid_w grid_h];
301)     time_grid{3,2} = [0.7 0.33 grid_w grid_h];
302)     time_grid{1,3} = [0.0 0.03 grid_w grid_h];
303)     time_grid{2,3} = [0.4 0.03 grid_w grid_h];
304)     time_grid{3,3} = [0.7 0.03 grid_w grid_h];
305) 
306)     lStart      = createLabel(pTime, cell2mat(time_grid(2,1)) ,'Start [sec]');
307)     lEnd        = createLabel(pTime, cell2mat(time_grid(3,1)) ,'End [sec]');
308)     lFrameShift = createLabel(pTime, cell2mat(time_grid(1,2)),'Frame Shift');
309)     lFramsSize  = createLabel(pTime, cell2mat(time_grid(1,3)),'Frame Size');
310)     
311)     model.txtFrameShiftStart   = createTextField(pTime,cell2mat(time_grid(2,2)),DEFAULT.frameshiftstart);
312)     model.txtFrameShiftEnd     = createTextField(pTime,cell2mat(time_grid(3,2)),DEFAULT.frameshiftend);
313)     model.txtFrameShiftDur     = createTextField(pTime,cell2mat(time_grid(2,3)),DEFAULT.frameshiftdur);
314) 

315)     

316) pSVM = uipanel(parent,'Units','normalized','Position',[0 0.4 0.5 0.4]);

317)     set(pSVM,'Title','SVM Classification');
318)     set(pSVM,'BackgroundColor',basecolor);
319) 

320)     model.txtSVMopts = createTextField(pSVM,[0 0.83 1 0.16],DEFAULT.svmoptstring);

321)     set(model.txtSVMopts,'HorizontalAlignment','left');
322)     

323)     model.txtSVMnfold = createTextField(pSVM,[0.0 0.66 0.5 0.16],DEFAULT.svmnfold);

324)     createLabel(pSVM,[0.5 0.50 0.5 0.25 ],'-Fold CrossVal');
325)     

326)     model.chkSVMrnd = uicontrol(pSVM,'Style','checkbox','Units','normalized','Position',[0.1 0.50 0.9 0.16]);

327)     set(model.chkSVMrnd,'String','Randomize Datapoints');
328)     set(model.chkSVMrnd,'BackgroundColor','w');
329)     set(model.chkSVMrnd,'Value',DEFAULT.svmrnd);
330)     

331)     btnRunSVM = uicontrol(pSVM,'String','run batchmode SVM Crossvalidation',...
332)         'Units','normalized',...
333)         'Position',[0 0.25 1 0.25]);
334)     set(btnRunSVM,'Enable','on');
335)     
336)     btnRunXSVM = uicontrol(pSVM,'String','run SVM X-Subject validation',...
337)         'Units','normalized',...
338)         'Position',[0 0.0 1 0.25]);
339)     set(btnRunXSVM,'Enable','on');

340)     

341) pSOM = uipanel(parent,'Units','normalized','Position',[0.5 0.4 0.5 0.4]);

342)     set(pSOM,'Title','SOM Classification');
343)     set(pSOM,'BackgroundColor',basecolor);
344) 

345)     createLabel(pSOM,[0 0.75 0.3 0.20],'Size:');
346)     model.txtSomM = createTextField(pSOM,[0.3 0.75 0.25 0.2],DEFAULT.somM);
347)     somsizemal = createLabel(pSOM,[0.55 0.75 0.2 0.20],'x');
348)     set(somsizemal,'HorizontalAlignment','center');
349)     model.txtSomN = createTextField(pSOM,[0.75 0.75 0.25 0.20],DEFAULT.somN);
350)  
351)     latticeModel = {'rect','hexa'};
352)     model.selSomLattice = uicontrol(pSOM,'Style','popupmenu',...
353)         'Units','normalized',...
354)         'Position',[0.0 0.5 0.3 0.20],...
355)         'String',latticeModel,...
356)         'UserData',latticeModel,...
357)         'Value',1);
358)     set(model.selSomLattice,'BackgroundColor','w');

359) 

360)     model.txtSOMnfold = createTextField(pSOM,[0.5 0.50 0.25 0.20],DEFAULT.svmnfold);
361) %     set(model.txtSOMnfold,'Enable','off');
362)     createLabel(pSOM,[0.75 0.5 0.25 0.20 ],'-Fold CrossVal');
363)        

364) 
365)     btnRunSOM = uicontrol(pSOM,'String','run SOM Crossvalidation',...
366)         'Units','normalized',...

367)         'Position',[0.0 0.25 1 0.25]);

368)     set(btnRunSOM,'Enable','on');

369) 
370)     btnRunXSOM = uicontrol(pSOM,'String','run SOM X-Subject validation',...
371)         'Units','normalized',...
372)         'Position',[0.0 0.0 1 0.25]);

373)     set(btnRunXSOM,'Enable','on');

374)     

375) pSearchlight = uipanel(parent,'Units','normalized','Position',[0.0 0.1 0.5 0.3]);

376)     set(pSearchlight,'Title','Spatiotemporal FB classification');
377)     set(pSearchlight,'BackgroundColor',basecolor);
378)     
379)     lSearchligh = createLabel(pSearchlight, [0 0.6 0.5 0.3],'Searchlight Radius');
380)     model.txtSearchlightRadius = createTextField(pSearchlight,[0.5 0.6 0.5 0.3],DEFAULT.searchlightradius);
381)     

382)     lFBSTiming = createLabel(pSearchlight, [0 0.3 0.5 0.3],'Optional Timeline ( e.g. ''-5 0 5 10 15'')');

383)     model.txtSearchlightTimeline = createTextField(pSearchlight,[0.5 0.3 0.5 0.3],DEFAULT.searchlightTimeline);
384) 

385)     btnRunFBS = uicontrol(pSearchlight,'String','run Spatiotemporal FB classification',...
386)         'Units','normalized',...
387)         'Position',[0.0 0.0 1 0.3]);

388)     set(btnRunFBS,'Enable','on');

389)     

390) 
391) % button callbacks set here, because of model.
392)     set(btnRunSVM, 'Callback',{@cbRunDecode,model,'SVM'}); 
393)     set(btnRunXSVM,'Callback',{@cbRunDecode,model,'XSVM'}); 
394)     set(btnRunSOM, 'Callback',{@cbRunDecode,model,'SOM'});

395)     set(btnRunXSOM,'Callback',{@cbRunDecode,model,'XSOM'});

396)     set(btnRunFBS, 'Callback',{@cbRunDecode,model,'FBS'});

397) end
398) 

399) function model = createVisualStepPanel(model,parent,DEFAULT)

400) 
401)     grid_h = 0.25;
402)     grid_w = 0.5;
403)     plot_grid = cell([3 3]);
404)     plot_grid{1,1} = [0.0 0.63 grid_w grid_h];
405)     plot_grid{1,2} = [0.0 0.33 grid_w grid_h];
406)     plot_grid{1,3} = [0.0 0.03 grid_w grid_h];

407)     plot_grid{2,1} = [0.25 0.63 grid_w grid_h];
408)     plot_grid{2,2} = [0.25 0.33 grid_w grid_h];
409)     plot_grid{2,3} = [0.25 0.03 grid_w grid_h];

410) 

411)     pButtonPane = uipanel(parent,'Units','normalized','Position',[0 0.5 1 0.5]);

412) %     set(pButtonPane,'Title','Plot');
413)     set(pButtonPane,'BackgroundColor','w');

414)     
415)     btnPlot03 = uicontrol(pButtonPane,'String','plot PSTH',...
416)         'Units','normalized',...
417)         'Position',cell2mat(plot_grid(2,1)));
418)     set(btnPlot03,'Callback',{@cbPlot,model,'psth'}); 
419)     set(btnPlot03,'Enable','on');
420)   

421)     btnPlot01 = uicontrol(pButtonPane,'String','plot performance and SE',...

422)         'Units','normalized',...

423)         'Position',cell2mat(plot_grid(2,2)));

424)     set(btnPlot01,'Callback',{@cbPlot,model,'simple'});

425)     set(btnPlot01,'Enable','on');

426)     
427)     btnPlot02 = uicontrol(pButtonPane,'String','plot subject performance and mean with SE',...
428)         'Units','normalized',...

429)         'Position',cell2mat(plot_grid(2,3)));

430)     set(btnPlot02,'Callback',{@cbPlot,model,'x-subject-val'});
431)     set(btnPlot02,'Enable','on');
432) 
433)     

434) end
435) 

436) 

437) function cbSwitchTask(src,evnt,task,taskpanel,model)

438) set(taskpanel.preprocessing,'Visible','off');
439) set(taskpanel.classification,'Visible','off');

440) set(taskpanel.plot,'Visible','off');

441) 
442) switch task
443)     case 'PRE'
444)         set(taskpanel.preprocessing,'Visible','on');

445) 
446) 

447)     case 'CLASSIFY'
448)         set(taskpanel.classification,'Visible','on');

449) 

450)     case 'PLOT'

451)         set(taskpanel.plot,'Visible','on');

452)         

453) end

454) 
455) assignin('base','model',model);
456) 

457) end
458) 

459) 

460) function cbRunPreprocessing(src,evnt,model,task)

461) main(model,'pre',task);
462) end
463) 
464) function cbRunDecode(src,evnt,model,task)
465) main(model,'decode',task);

466) end
467) 

468) function cbPlot(src,evnt,model,type)
469) main(model,'plot',type);
470) end
471) 
472) 

473) function model = mcb_cd(src,evnt,model)
474) disp('CD');
475) directory_name = uigetdir(model.baseDir,'Select Study Base Directory ...');
476) model.baseDir = directory_name;
477) model = scanDirs(model);
478) end
479) 
480) function mcb_save(src,evnt,model)
481) disp('SAVE');
482) baseDir  = model.baseDir;
483) timeLine = getTimeLineParams(model);
484) classDefString = getClassDefString(model);
485) coordDefString = getCoordDefString(model);
486) 
487) [file path] = uiputfile('*.mat','Save current Params ...',model.baseDir);
488) save( fullfile(path,file),'baseDir','timeLine','classDefString','coordDefString') ;
489) end
490) 
491) function model = mcb_load(src,evnt,model)
492) disp('LOAD');
493) [file path] = uigetfile('*.mat','Load Params ...',model.baseDir);
494) l = load(fullfile(path,file));
495) % assignin('base','l',l);
496) model = setTimeLineParams(model,l.timeLine);
497) model = setClassDefString(model,l.classDefString);
498) model = setCoordDefString(model,l.coordDefString);
499) model.baseDir = l.baseDir;
500) model = scanDirs(model);
501) 
502) end
503) 

504) function label = createLabel(parent,  pos, labelText)
505)     label = uicontrol(parent,'Style','text','Units','normalized','String',labelText,'Position',pos);
506)     set(label,'HorizontalAlignment','left');
507)     set(label,'BackgroundColor','w');
508) end
509) 
510) function txt = createTextField(parent,pos,model)

511) %     textfieldcolor = [0.9 0.9 0.0];
512)     textfieldcolor = 'w';